《战争机器4》以马库斯之子JD为主角所展开, 时间设置为《战争机器3》成功战胜由兽族女皇带领的兽族之后十余年。这时马库斯已退休, 大部分人类正在新一代的维安政府的带领下开始新的生活。这时他们又受到了新敌人“蜂族”所带来的威胁。